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本書是作者近年來研究蛋白質折疊速率所得成果的系統總結。主要內容包括:蛋白質折疊速率研究進展、蛋白質結構的預測方法、基因序列資訊參數對蛋白質折疊速率的影響、回文結構及其統計分析、回文結構對蛋白質折疊速率的影響、同義密碼子的使用偏性及其對肽鏈折疊速率的影響、mRNA二級結構及其對蛋白質折疊速率的影響等。本書可供生物物理專業研究生及相關研究者參考。
- 封面
- 版权信息
- 目录
- 前言
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第1章 绪论
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1.1 研究背景
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1.2 本书结构
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参考文献
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第2章 蛋白质的折叠速率
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2.1 蛋白质的折叠速率研究进展
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2.1.1 基于蛋白质三级结构的预测方法
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2.1.2 基于蛋白质二级结构的预测方法
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2.1.3 基于蛋白质一级结构的预测方法
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2.2 氨基酸片段的极性对相应肽链折叠速率的影响
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2.2.1 材料准备
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2.2.2 统计分析
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2.2.3 研究结果
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2.2.4 讨论
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2.3 mRNA对蛋白质结构的影响
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2.3.1 mRNA对蛋白质结构影响的必然性分析
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2.3.2 数据获得方法
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2.3.3 数据分析方法
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参考文献
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第3章 基因序列信息参数对蛋白质折叠速率的影响
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3.1 全β类蛋白质mRNA序列的GC含量对蛋白质折叠速率的影响
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3.1.1 材料
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3.1.2 统计分析
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3.1.3 结果
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3.1.4 讨论
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3.2 核苷酸统计关联
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3.3 mRNA序列信息参数对蛋白质折叠速率的影响
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3.3.1 材料
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3.3.2 统计分析
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3.3.3 结果与讨论
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参考文献
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第4章 回文结构
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4.1 回文结构及其生物学意义
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4.1.1 回文结构的意义
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4.1.2 回文结构的获得
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4.2 SARS病毒全序列回文结构的统计分析
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4.2.1 材料的选取
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4.2.2 研究方法
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4.2.3 结果
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4.2.4 讨论
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4.3 艾滋病病毒全序列回文结构的统计分析
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4.3.1 回文结构的统计
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4.3.2 结果与讨论
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4.3.3 结论
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参考文献
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第5章 回文结构对蛋白质折叠速率的影响
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5.1 病毒mRNA序列中回文结构对蛋白质折叠速率的影响
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5.1.1 材料
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5.1.2 统计分析
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5.1.3 结果
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5.1.4 讨论
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5.2 全β类蛋白质相应mRNA序列中的回文结构对蛋白质折叠速率的影响
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5.2.1 材料
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5.2.2 统计分析
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5.2.3 结果
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5.2.4 讨论
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5.3 mRNA序列中回文结构对蛋白质折叠速率的影响
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5.3.1 数据
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5.3.2 统计分析
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5.3.3 结果
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5.3.4 讨论
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参考文献
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第6章 同义密码子的使用偏性
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6.1 mRNA同义密码子的使用偏性
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6.1.1 同义密码子使用偏性
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6.1.2 同义密码子使用偏性分析方法
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6.2 大肠杆菌核蛋白的同义密码子使用偏性对肽链折叠速率的影响
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6.2.1 材料
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6.2.2 统计分析
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6.2.3 结果
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6.2.4 讨论
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6.3 枯草芽孢杆菌核蛋白同义密码子使用偏性对肽链折叠速率的影响
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6.3.1 材料
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6.3.2 统计分析
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6.3.3 结果
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6.3.4 讨论
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6.4 人类核蛋白同义密码子使用偏性对肽链折叠速率的影响
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6.4.1 材料
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6.4.2 结果
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6.4.3 讨论
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6.5 同义密码子的使用偏性对蛋白质折叠速率的影响
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6.5.1 材料
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6.5.2 统计分析
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6.5.3 结果
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6.5.4 讨论
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参考文献
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第7章 mRNA二级结构及其对蛋白质折叠速率的影响
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7.1 RNA二级结构
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7.1.1 RNA二级结构预测算法
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7.1.2 RNA二级结构的元件
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7.1.3 二级结构的图形表示方法
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7.1.4 RNA二级结构特征量提取
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7.2 A型流感病毒同义密码子的使用偏性对mRNA二级结构的影响
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7.2.1 材料
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7.2.2 分析方法
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7.2.3 结果
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7.2.4 讨论
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7.3 冠状病毒同义密码子的使用偏性对mRNA二级结构的影响
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7.3.1 材料
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7.3.2 统计分析
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7.3.3 结果
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7.3.4 讨论
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7.4 mRNA的二级结构对蛋白质折叠速率的影响
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7.4.1 数据集
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7.4.2 分析方法
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7.4.3 结果
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7.4.4 讨论
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参考文献
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- 第8章 总结与展望
- 出版地 : 中國大陸
- 語言 : 簡體中文
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